Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms