Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHGAP10645 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHGAP10645 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHGAP10645 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHGAP10645 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHGAP10645 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHGAP10645 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHGAP10645 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHGAP10645 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CHGAP10645 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHGAP10645 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHGAP10645 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHGAP10645 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHGAP10645 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHGAP10645 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHGAP10645 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHGAP10645 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHGAP10645 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHGAP10645 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CHGAP10645 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHGAP10645 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHGAP10645 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHGAP10645 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHGAP10645 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHGAP10645 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHGAP10645 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHGAP10645 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHGAP10645 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHGAP10645 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHGAP10645 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHGAP10645 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHGAP10645 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHGAP10645 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHGAP10645 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHGAP10645 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHGAP10645 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHGAP10645 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHGAP10645 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHGAP10645 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHGAP10645 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHGAP10645 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHGAP10645 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHGAP10645 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHGAP10645 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHGAP10645 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHGAP10645 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHGAP10645 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHGAP10645 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHGAP10645 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHGAP10645 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHGAP10645 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHGAP10645 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHGAP10645 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHGAP10645 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHGAP10645 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHGAP10645 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHGAP10645 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHGAP10645 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHGAP10645 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHGAP10645 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CHGAP10645 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CHGAP10645 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CHGAP10645 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHGAP10645 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHGAP10645 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHGAP10645 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHGAP10645 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHGAP10645 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHGAP10645 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHGAP10645 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHGAP10645 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHGAP10645 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms