Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms