Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC172P0C7W6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms