Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIL1P09327 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VIL1P09327 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIL1P09327 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIL1P09327 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIL1P09327 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIL1P09327 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIL1P09327 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIL1P09327 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIL1P09327 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VIL1P09327 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIL1P09327 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIL1P09327 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIL1P09327 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIL1P09327 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIL1P09327 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VIL1P09327 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VIL1P09327 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VIL1P09327 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VIL1P09327 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VIL1P09327 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VIL1P09327 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VIL1P09327 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VIL1P09327 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
VIL1P09327 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIL1P09327 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIL1P09327 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIL1P09327 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIL1P09327 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIL1P09327 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIL1P09327 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIL1P09327 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIL1P09327 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIL1P09327 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIL1P09327 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VIL1P09327 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIL1P09327 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIL1P09327 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIL1P09327 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIL1P09327 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VIL1P09327 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIL1P09327 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIL1P09327 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIL1P09327 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIL1P09327 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIL1P09327 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIL1P09327 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIL1P09327 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIL1P09327 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIL1P09327 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIL1P09327 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIL1P09327 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VIL1P09327 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIL1P09327 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VIL1P09327 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIL1P09327 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIL1P09327 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIL1P09327 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIL1P09327 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VIL1P09327 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIL1P09327 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIL1P09327 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIL1P09327 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VIL1P09327 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VIL1P09327 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VIL1P09327 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VIL1P09327 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VIL1P09327 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VIL1P09327 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VIL1P09327 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VIL1P09327 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VIL1P09327 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VIL1P09327 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms