Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms