Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYBBP04839 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYBBP04839 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYBBP04839 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYBBP04839 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CYBBP04839 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYBBP04839 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYBBP04839 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYBBP04839 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYBBP04839 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYBBP04839 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYBBP04839 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYBBP04839 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYBBP04839 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYBBP04839 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYBBP04839 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms