Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCATO75600 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCATO75600 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCATO75600 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCATO75600 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCATO75600 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCATO75600 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GCATO75600 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCATO75600 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCATO75600 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCATO75600 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCATO75600 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCATO75600 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCATO75600 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCATO75600 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCATO75600 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCATO75600 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCATO75600 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCATO75600 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCATO75600 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCATO75600 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCATO75600 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GCATO75600 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCATO75600 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCATO75600 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GCATO75600 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCATO75600 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms