Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMDSO60547 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GMDSO60547 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GMDSO60547 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GMDSO60547 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GMDSO60547 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMDSO60547 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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