Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP3LO60238 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP3LO60238 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP3LO60238 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNIP3LO60238 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNIP3LO60238 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNIP3LO60238 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNIP3LO60238 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNIP3LO60238 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNIP3LO60238 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNIP3LO60238 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNIP3LO60238 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNIP3LO60238 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNIP3LO60238 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP3LO60238 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms