Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PDE6DO43924 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PDE6DO43924 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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PDE6DO43924 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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