Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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