Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRODHO43272 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRODHO43272 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRODHO43272 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRODHO43272 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRODHO43272 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRODHO43272 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRODHO43272 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRODHO43272 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRODHO43272 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRODHO43272 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRODHO43272 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRODHO43272 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRODHO43272 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRODHO43272 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRODHO43272 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRODHO43272 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRODHO43272 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRODHO43272 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRODHO43272 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRODHO43272 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRODHO43272 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRODHO43272 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRODHO43272 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRODHO43272 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRODHO43272 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRODHO43272 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRODHO43272 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRODHO43272 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRODHO43272 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRODHO43272 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRODHO43272 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRODHO43272 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRODHO43272 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRODHO43272 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PRODHO43272 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRODHO43272 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRODHO43272 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRODHO43272 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRODHO43272 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRODHO43272 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRODHO43272 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRODHO43272 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRODHO43272 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRODHO43272 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRODHO43272 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRODHO43272 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRODHO43272 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PRODHO43272 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms