Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms