Protein–RNA interactions for Protein: O14829

PPEF1, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF1O14829 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPEF1O14829 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms