Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APAF1O14727 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APAF1O14727 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APAF1O14727 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APAF1O14727 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APAF1O14727 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APAF1O14727 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APAF1O14727 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APAF1O14727 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APAF1O14727 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APAF1O14727 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APAF1O14727 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APAF1O14727 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APAF1O14727 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APAF1O14727 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APAF1O14727 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APAF1O14727 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
APAF1O14727 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APAF1O14727 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APAF1O14727 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APAF1O14727 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APAF1O14727 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
APAF1O14727 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APAF1O14727 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APAF1O14727 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APAF1O14727 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APAF1O14727 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APAF1O14727 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APAF1O14727 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APAF1O14727 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APAF1O14727 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APAF1O14727 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APAF1O14727 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APAF1O14727 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APAF1O14727 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
APAF1O14727 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APAF1O14727 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
APAF1O14727 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APAF1O14727 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APAF1O14727 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APAF1O14727 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APAF1O14727 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
APAF1O14727 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APAF1O14727 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APAF1O14727 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APAF1O14727 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APAF1O14727 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APAF1O14727 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APAF1O14727 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APAF1O14727 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APAF1O14727 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APAF1O14727 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APAF1O14727 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APAF1O14727 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APAF1O14727 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APAF1O14727 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APAF1O14727 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APAF1O14727 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APAF1O14727 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
APAF1O14727 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APAF1O14727 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APAF1O14727 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
APAF1O14727 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APAF1O14727 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
APAF1O14727 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APAF1O14727 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APAF1O14727 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APAF1O14727 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APAF1O14727 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APAF1O14727 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APAF1O14727 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APAF1O14727 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APAF1O14727 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APAF1O14727 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APAF1O14727 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APAF1O14727 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APAF1O14727 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APAF1O14727 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APAF1O14727 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APAF1O14727 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APAF1O14727 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APAF1O14727 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APAF1O14727 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APAF1O14727 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APAF1O14727 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APAF1O14727 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APAF1O14727 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APAF1O14727 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APAF1O14727 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APAF1O14727 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APAF1O14727 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APAF1O14727 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APAF1O14727 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APAF1O14727 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APAF1O14727 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APAF1O14727 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APAF1O14727 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APAF1O14727 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APAF1O14727 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APAF1O14727 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms