Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD8O14715 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms