Protein–RNA interactions for Protein: O14656

TOR1A, Torsin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1AO14656 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms