Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLRMTO00411 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms