Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCER2I3L3R5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms