Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms