Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms