Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOBPA7XYQ1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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