Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms