Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms