Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBA6A0AVT1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms