Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETBP1Q9Y6X0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms