Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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HCN4Q9Y3Q4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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HCN4Q9Y3Q4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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HCN4Q9Y3Q4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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HCN4Q9Y3Q4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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HCN4Q9Y3Q4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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HCN4Q9Y3Q4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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HCN4Q9Y3Q4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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HCN4Q9Y3Q4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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HCN4Q9Y3Q4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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HCN4Q9Y3Q4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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