Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms