Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR1DQ9Y2S0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms