Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA11Q9UKX5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms