Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms