Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms