Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NPC1L1Q9UHC9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPC1L1Q9UHC9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms