Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms