Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA6Q9UF33 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA6Q9UF33 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms