Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK4Q9UBT3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms