Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms