Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms