Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
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