Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRBP1Q9P2E9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms