Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms