Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALKBH4Q9NXW9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALKBH4Q9NXW9 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms