Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms