Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms