Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAK1IP1Q9NWT1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms