Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms