Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNTG1Q9NSN8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms