Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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