Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms